| 新疆农垦科学院>科研管理处 | 自然科学 | | 2 | 若干 | 学科门类：研究生：农学(09) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>畜牧兽医研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：畜牧学(090500)、兽医学(090600)、动物营养与饲料科学(090502)；一级学科：研究生：畜牧学(0905)、兽医学(0906) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>畜牧兽医研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：动物遗传育种与繁殖(090501) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>机械装备研究所 | 自然科学 | | 2 | 若干 | 二级学科：研究生：机械工程(080200)、机械工程(085501)、机械制造及其自动化(080201)、农业工程(082800)、农业机械化工程(082801)、农业电气化与自动化(082804)、机械电子工程(080202)、电力电子与电力传动(080804)、电机与电器(080801)、控制科学与工程(081100)；一级学科：研究生：机械工程(0802)、农业工程(0828)、控制科学与工程(0811) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>棉花研究所 | 自然科学 | | 2 | 若干 | 二级学科：研究生：作物学(090100)、生物学(071000)、植物学(071001)、植物保护(090400)、植物病理学(090401)；一级学科：研究生：作物学(0901)、生物学(0710)、植物保护(0904) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>林园研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：作物学(090100)、园艺学(090200)、林学(090700)、生物学(071000)、微生物学(071005)、植物营养学(090302)、土壤学(090301)；一级学科：研究生：作物学(0901)、园艺学(0902)、林学(0907)、生物学(0710) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>农田水利与土壤肥料研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：园艺学(090200)、果树学(090201)；一级学科：研究生：园艺学(0902) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>农田水利与土壤肥料研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：生物学(071000)、微生物学(071005)；一级学科：研究生：生物学(0710) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>农产品加工研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：食品科学与工程(083200)、食品科学与工程(097200)；一级学科：研究生：食品科学与工程(0832)、食品科学与工程(0972) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |
| 新疆农垦科学院>科技信息研究所 | 自然科学 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：农林经济管理(120300)、应用经济学(020200)；一级学科：研究生：农林经济管理(1203)、应用经济学(0202) | 仅限博士研究生 | 新疆 | 详情 |