| 土壤与地下水污染防治研究室 | 土壤与地下水污染修复研究 | | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：地质学(0709)；二级学科：研究生：地质学(070900)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 土壤与地下水污染防治研究室 | 土壤与地下水污染防治研究 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：环境工程(077602)、环境科学(077601)；二级学科：研究生：环境工程(083002)、环境科学(083001)；二级学科：研究生：环境科学(097101)、环境工程(097102)；二级学科：研究生：环境工程(085701)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 企业用地土壤环境管理研究室 | 企业用地土壤状况调查与风险评估 | | 2 | 若干 | 一级学科：研究生：地质学(0709)；二级学科：研究生：地质学(070900)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 农用化学品污染防治研究室 | 新污染物环境归趋研究 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：环境科学(077601)；二级学科：研究生：环境科学(083001)；二级学科：研究生：环境科学(097101)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 有毒有害物质环境健康研究室 | 新污染物环境暴露检测 | | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：化学(0703)；二级学科：研究生：分析化学(070302)、化学(070300)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 化学品危害鉴别与暴露评估研究室 | 新污染物环境暴露实测与评估 | | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：化学(0703)；二级学科：研究生：药物分析学(078004)；二级学科：研究生：化学(070300)；二级学科：研究生：药物分析学(100704)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 流域水污染防治研究室 | 流域污染防治与生态修复 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：环境工程(077602)、环境科学(077601)；二级学科：研究生：环境工程(083002)、环境科学(083001)；二级学科：研究生：环境科学(097101)、环境工程(097102)；二级学科：研究生：环境工程(085701)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 流域水污染防治研究室 | 水处理与修复 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：环境科学(077601)；二级学科：研究生：环境科学(083001)；二级学科：研究生：环境科学(097101)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 有机食品发展研究室 | 农林业碳汇研究 | | 2 | 若干 | 二级学科：研究生：微生物学(071005)；二级学科：研究生：土壤学(090301)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |
| 环境应急技术研究室 | VOCs协同异味治理 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：环境工程(077602)、环境科学(077601)；二级学科：研究生：环境工程(083002)、环境科学(083001)；二级学科：研究生：环境科学(097101)、环境工程(097102)；二级学科：研究生：环境工程(085701)； | 仅限博士研究生 | 南京市 | 详情 |