| 生态所 | 环境微生物及应用 | | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：生物学(0710)；二级学科：研究生：微生物学(071005)、生物学(071000)；二级学科：研究生：土壤学(090301)； | 仅限博士研究生 | 上海市 | 详情 |
| 生态所 | 植物病理研究 | | 1 | 若干 | 二级学科：研究生：微生物学(071005)、遗传学(071007)；二级学科：研究生：植物病理学(090401)； | 仅限博士研究生 | 上海市 | 详情 |
| 生态所 | 杂草资源开发与利用 | | 1 | 若干 | 一级学科：研究生：食品科学与工程(0832)；二级学科：研究生：食品科学与工程(083200)；一级学科：研究生：草学(0909)、食品科学与工程(0972)、食品与营养(0955)；二级学科：研究生：食品科学与工程(097200)；二级学科：研究生：草学(090900)；二级学科：研究生：资源利用与植物保护(095132)；二级学科：研究生：食品与营养(095500)； | 仅限博士研究生 | 上海市 | 详情 |
| 生态所 | 土壤修复与保育 | | 1 | 若干 | 学科门类：研究生：交叉学科(14)；一级学科：研究生：环境科学与工程(0776)；二级学科：研究生：环境科学与工程(077600)；一级学科：研究生：环境科学与工程(0830)；二级学科：研究生：环境科学与工程(083000)；一级学科：研究生：农业资源与环境(0903)、环境科学与工程(0971)；二级学科：研究生：作物遗传育种(090102)；二级学科：研究生：农业资源与环境(090300)；二级学科：研究生：环境科学与工程(097100)； | 仅限博士研究生 | 上海市 | 详情 |